MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 30148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013926	TGC	3	9	178366	178374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595844
3502	NC_013926	ATG	2	6	178484	178489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595844
3503	NC_013926	AAAT	2	8	178519	178526	75 %	25 %	0 %	0 %	289595844
3504	NC_013926	AGA	2	6	178540	178545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595844
3505	NC_013926	TA	3	6	178653	178658	50 %	50 %	0 %	0 %	289595845
3506	NC_013926	ATT	2	6	178712	178717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595845
3507	NC_013926	GA	3	6	178771	178776	50 %	0 %	50 %	0 %	289595845
3508	NC_013926	TTC	2	6	178852	178857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595845
3509	NC_013926	ACA	2	6	178868	178873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595845
3510	NC_013926	GGC	2	6	179081	179086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289595845
3511	NC_013926	A	6	6	179106	179111	100 %	0 %	0 %	0 %	289595845
3512	NC_013926	CATA	2	8	179142	179149	50 %	25 %	0 %	25 %	289595845
3513	NC_013926	CCA	2	6	179154	179159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595846
3514	NC_013926	TCT	2	6	179209	179214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595846
3515	NC_013926	CAT	2	6	179240	179245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595846
3516	NC_013926	CT	3	6	179249	179254	0 %	50 %	0 %	50 %	289595846
3517	NC_013926	TCT	2	6	179261	179266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595846
3518	NC_013926	TCAC	2	8	179274	179281	25 %	25 %	0 %	50 %	289595846
3519	NC_013926	GCA	2	6	179293	179298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289595846
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3521	NC_013926	TTC	2	6	179337	179342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595846
3522	NC_013926	TCT	2	6	179406	179411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595846
3523	NC_013926	TAT	2	6	179450	179455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595846
3524	NC_013926	CTT	2	6	179477	179482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595846
3525	NC_013926	AAAT	2	8	179519	179526	75 %	25 %	0 %	0 %	289595846
3526	NC_013926	ATA	2	6	179538	179543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595846
3527	NC_013926	T	7	7	179602	179608	0 %	100 %	0 %	0 %	289595846
3528	NC_013926	CTTC	2	8	179623	179630	0 %	50 %	0 %	50 %	289595846
3529	NC_013926	CTC	2	6	179656	179661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595846
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3531	NC_013926	TTTC	2	8	179716	179723	0 %	75 %	0 %	25 %	289595846
3532	NC_013926	TCC	2	6	179730	179735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595846
3533	NC_013926	TGC	2	6	179826	179831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595846
3534	NC_013926	ATC	2	6	179840	179845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595846
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3536	NC_013926	TA	3	6	179909	179914	50 %	50 %	0 %	0 %	289595846
3537	NC_013926	ATTG	2	8	179931	179938	25 %	50 %	25 %	0 %	289595846
3538	NC_013926	CCT	2	6	180063	180068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595847
3539	NC_013926	TAT	2	6	180085	180090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595847
3540	NC_013926	AAT	2	6	180123	180128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595847
3541	NC_013926	CTA	2	6	180203	180208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595847
3542	NC_013926	ACA	2	6	180209	180214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595847
3543	NC_013926	ATG	2	6	180226	180231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595847
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3546	NC_013926	GCT	2	6	180263	180268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595847
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3548	NC_013926	CTC	2	6	180330	180335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595847
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3550	NC_013926	GGA	2	6	180542	180547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595847
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3552	NC_013926	TCA	2	6	180611	180616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595847
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3556	NC_013926	GAA	2	6	180712	180717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595847
3557	NC_013926	GATA	2	8	180742	180749	50 %	25 %	25 %	0 %	289595847
3558	NC_013926	CCT	2	6	180812	180817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595847
3559	NC_013926	TTC	2	6	180836	180841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595847
3560	NC_013926	TCT	2	6	180848	180853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595847
3561	NC_013926	AG	3	6	180858	180863	50 %	0 %	50 %	0 %	289595847
3562	NC_013926	TTC	2	6	180973	180978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595847
3563	NC_013926	CTTT	2	8	181020	181027	0 %	75 %	0 %	25 %	289595847
3564	NC_013926	AT	3	6	181100	181105	50 %	50 %	0 %	0 %	289595847
3565	NC_013926	TCA	2	6	181205	181210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595847
3566	NC_013926	CTG	2	6	181302	181307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595847
3567	NC_013926	TCTCA	2	10	181324	181333	20 %	40 %	0 %	40 %	289595847
3568	NC_013926	TCC	2	6	181396	181401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595847
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3570	NC_013926	CCG	2	6	181443	181448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289595847
3571	NC_013926	ATT	2	6	181477	181482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595847
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3573	NC_013926	TGAA	2	8	181596	181603	50 %	25 %	25 %	0 %	289595847
3574	NC_013926	ATGA	2	8	181636	181643	50 %	25 %	25 %	0 %	289595847
3575	NC_013926	TCC	2	6	181718	181723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595847
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3585	NC_013926	TGAT	2	8	182417	182424	25 %	50 %	25 %	0 %	289595847
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3591	NC_013926	CCA	2	6	183197	183202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595849
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3594	NC_013926	CAG	2	6	183371	183376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289595849
3595	NC_013926	CAAC	2	8	183401	183408	50 %	0 %	0 %	50 %	289595849
3596	NC_013926	CT	3	6	183418	183423	0 %	50 %	0 %	50 %	289595849
3597	NC_013926	T	6	6	183516	183521	0 %	100 %	0 %	0 %	289595849
3598	NC_013926	CTTCT	2	10	183564	183573	0 %	60 %	0 %	40 %	289595849
3599	NC_013926	CATG	2	8	183584	183591	25 %	25 %	25 %	25 %	289595849
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3601	NC_013926	TCCT	2	8	183720	183727	0 %	50 %	0 %	50 %	289595849
3602	NC_013926	TCA	2	6	183733	183738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595849
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3604	NC_013926	GA	3	6	183762	183767	50 %	0 %	50 %	0 %	289595849
3605	NC_013926	TTC	2	6	183777	183782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595849
3606	NC_013926	ATC	2	6	183816	183821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595849
3607	NC_013926	CTC	2	6	183827	183832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595849
3608	NC_013926	G	6	6	183862	183867	0 %	0 %	100 %	0 %	289595849
3609	NC_013926	CT	3	6	183940	183945	0 %	50 %	0 %	50 %	289595849
3610	NC_013926	CAA	2	6	184055	184060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595849
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3612	NC_013926	AG	3	6	184334	184339	50 %	0 %	50 %	0 %	289595850
3613	NC_013926	AGT	2	6	184354	184359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595850
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3617	NC_013926	CT	3	6	184505	184510	0 %	50 %	0 %	50 %	289595850
3618	NC_013926	TTA	2	6	184522	184527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595850
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3622	NC_013926	GA	3	6	184650	184655	50 %	0 %	50 %	0 %	289595850
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3995	NC_013926	TAA	2	6	204132	204137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595874
3996	NC_013926	TCC	2	6	204215	204220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595874
3997	NC_013926	ATA	2	6	204279	204284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595874
3998	NC_013926	GAT	2	6	204344	204349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595874
3999	NC_013926	CAC	2	6	204352	204357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595874
4000	NC_013926	AAT	2	6	204412	204417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595874

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